Bonjour Yves,
Avant de vous conseiller, je corrige l'expression plein-pied: c'est plain-pied (du latin planus, plat)
http://fr.wiktionary.org/wiki/de_plain-pied
Ensuite votre problème est hélas banal...
D'abord vous ne coupez rien du tout: le se rétracte et le dépassement des madriers est une garantie de la solidité du montage. Il existe depuis longtemps des montages en angle en queue d'aronde découverte, mais c'est réservé aux pièces de de bonne épaisseur. Cela donne ça:
N'essayez pas de faire la même chose avec vos madriers de 40mm...
Les angles sortants cachés, c'est demandé, ou plutôt exigé en ville; les constructeurs présentent parfois la formule comme une innovation...en réalité c'est très vieux comme procédé...Sinon le plus simple est de cacher les angles sortants en les enveloppant comme sur la photo ci-dessous:
Généralement ça suffit pour obtenir le permis...
Quelques liens utiles:
http://www..com/particuliers/construire/formalites-reglementation/construction-permis-construire
http://forums.futura-sciences.com/habitat-bioclimatique-isolation-chauffage/241710-permis-maison--refuse.html
http://urbanbois89.over-blog.com/article-maison--et-permis-de-construire-38430329.html
http://www.aureamaisonbois.com/v.2/site/index.php?option=com_content&view=article&id=18&Itemid=33